Kehidupan Koushi Nagumo yang berusia dua belas tahun tiba-tiba menurun ketika ayahnya meninggalkannya setelah rumah mereka terbakar. Dibiarkan berjuang sendiri, Koushi ambruk di jalan, tetapi seorang wanita eksentrik bernama Mineru Wachi mengasihani dia dan membawanya ke asrama wanita “Megami-ryou.”
Setelah mengetahui situasi Koushi, Mineru, yang kebetulan menjadi manajer sementara, mengundangnya untuk menjadi ibu asrama resmi Megami-ryou. Namun, apa yang menantinya adalah penghuni asrama—masing-masing dengan kekejaman anehnya sendiri—seperti Atena Saotome yang androfobia namun lembut, tomboi feminin Kiriya Senshou, dan Mineru sendiri, yang kecerobohannya tidak mengenal batas dalam hal sains. Meskipun demikian, Koushi melakukan yang terbaik untuk memenuhi tugas kehidupan baru yang gila ini!
