Setelah eksperimen alkimia yang mengerikan gagal di rumah tangga Elric, saudara laki-laki Edward dan Alphonse ditinggalkan dalam kenyataan baru yang membawa bencana. Mengabaikan prinsip alkimia yang melarang transmutasi manusia, anak-anak lelaki itu berusaha menghidupkan kembali ibu mereka yang baru saja meninggal. Sebaliknya, mereka menderita kerugian pribadi yang brutal: tubuh Alphonse hancur sementara Edward kehilangan satu kaki dan kemudian mengorbankan lengan untuk menjaga jiwa Alphonse di alam fisik dengan mengikatnya ke baju zirah raksasa.
Saudara-saudara diselamatkan oleh tetangga mereka Pinako Rockbell dan cucunya Winry. Dikenal sebagai ahli teknik bio-mekanik, Winry menciptakan kaki palsu untuk Edward dengan memanfaatkan “automail”, logam tangguh dan serbaguna yang digunakan dalam robot dan baju perang. Setelah bertahun-tahun pelatihan, Elric bersaudara memulai pencarian untuk memulihkan tubuh mereka dengan menemukan Batu Bertuah — permata kuat yang memungkinkan seorang alkemis menentang hukum tradisional Pertukaran Setara.
Saat Edward menjadi seorang alkemis terkenal dan mendapat julukan “Fullmetal,” perjalanan anak laki-laki itu melibatkan mereka dalam konspirasi yang berkembang yang mengancam nasib dunia.
