Setelah lima tahun menyimpan perasaan yang tak terucapkan, siswa sekolah menengah Taiju Ooki akhirnya siap untuk menyatakan cintanya kepada Yuzuriha Ogawa. Namun, ketika Taiju memulai pengakuannya, lampu hijau yang menyilaukan menyerang Bumi dan membatu umat manusia di seluruh dunia—mengubah setiap manusia menjadi batu.
Beberapa milenium kemudian, Taiju terbangun untuk menemukan dunia modern sama sekali tidak ada, karena alam telah berkembang di tahun-tahun umat manusia tidak bergerak. Di antara dunia patung batu, Taiju bertemu dengan satu manusia hidup lainnya: temannya yang mencintai sains Senkuu, yang telah aktif selama beberapa bulan. Taiju mengetahui bahwa Senkuu telah mengembangkan skema besar—untuk meluncurkan kebangkitan peradaban sepenuhnya dengan sains. Otot Taiju dan otak Senkuu bergabung untuk membentuk kemitraan yang tangguh, dan mereka segera menemukan metode untuk menghidupkan kembali mereka yang membatu.
Namun, rencana induk Senkuu terancam ketika ideologinya ditantang oleh mereka yang bangkit. Sementara itu, alasan membatu umat manusia masih belum diketahui.
