Penampakan makhluk misterius yang dikenal sebagai “Hantu Hologram” telah menjadi topik populer di jejaring sosial selama beberapa tahun terakhir. Menurut rumor, beberapa orang telah menjadi korban hantu ini. Mereka yang beruntung selamat dari pertemuan mereka dengan makhluk paranormal mengklaim bahwa mereka mirip dengan hologram yang rusak.
Siswa sekolah menengah Akademi Hazakura, Hiro Amanokawa, percaya bahwa penampakan ini hanyalah legenda urban. Namun, saat insiden mulai meningkat frekuensinya, dia teringat hari ayahnya tiba-tiba menghilang, dengan jam tangan digital aneh yang berfungsi sebagai satu-satunya peninggalan kepergiannya. Sama seperti penampakan lainnya, apa yang terjadi pada ayah Hiro tidak bisa dijelaskan dengan logika konvensional.
Suatu hari, ketika seorang siswa di akademi diserang oleh Hantu Hologram, Hiro dan temannya Kiyoshirou Higashimitarai memutuskan untuk menyelidiki masalah tersebut. Sedikit yang Hiro tahu bahwa penyelidikan ini akan menjadi langkah pertama mereka untuk menemukan dunia berbahaya yang sebelumnya tidak diketahui umat manusia.
