Di bawah doktrin Quirk Doomsday Theory, kelompok ideologis Humarise yakin bahwa semua manusia yang memiliki quirks adalah penyakit dan harus dibasmi. Untuk membangun kembali dunia, kelompok ekstremis telah membangun perangkat mematikan yang dikenal sebagai “Bom Pemicu” yang menyebabkan orang-orang dengan kebiasaan kehilangan kendali dan mati. Pemimpin mereka, Flect Turn, menghindari penangkapan dari Pahlawan Pro yang dikerahkan di seluruh dunia.
Selama studi kerjanya di negara Otheon dengan Pro Hero nomor satu Jepang, Izuku “Deku” Midoriya dituduh melakukan kejahatan yang tidak dilakukannya. Tanpa sengaja melibatkan Roddy Soul, seorang lokal, Deku segera menemukan dirinya dalam pelarian dengan bocah itu. Sekarang terserah kepada Rody, Deku, dan teman sekelas Deku untuk menghentikan plot Trigger Bomb yang digerakkan oleh Flect, sambil menghindari anggota Humarise yang gigih lainnya.
